Odwołania w sprawach aptek leżały w GIF nawet 1232 dni, a w tym czasie apteki działały dalej
NIK sprawdziła osiem odwołań od decyzji wojewódzkich inspektorów farmaceutycznych i we wszystkich uznała, że GIF prowadził je przewlekle. Wystąpienie pokontrolne opublikowano 8 października 2026 r., a ogólna ocena GIF jest pozytywna.

Najwyższa Izba Kontroli zarzuca Głównemu Inspektoratowi Farmaceutycznemu jedno: przewlekłe rozpatrywanie odwołań. Kontrola objęła lata 2020–2025, a wystąpienie pokontrolne ukazało się 8 października 2026 r. Wszystkie osiem zbadanych spraw ciągnęło się zbyt długo, a strony nie dostawały zawiadomień o przyczynie zwłoki i nowym terminie, choć wymaga tego art. 36 § 1 Kpa.
Do 20 lutego 2026 r. pięć spraw się zakończyło, a trzy nadal czekały. Zakończone trwały 1232, 1062, 991, 579 i 343 dni. GIF tłumaczył to brakami kadrowymi. NIK zwraca uwagę, że miał pełne akta od przekazania sprawy i nie zbierał nowych dowodów.
Skutek dla aptek jest taki, że odwołanie złożone w terminie wstrzymuje wykonanie decyzji, także o cofnięciu zezwolenia. Apteka mogła więc pracować dalej, nierzadko przez lata. Zaległości widać w liczbach: we Wrocławiu na koniec 2025 r. czekały 30 zaskarżonych decyzji, w Gdańsku według stanu na 20 listopada 2025 r. 29, a w Warszawie 15 decyzji o cofnięciu zezwolenia po utracie rękojmi.
Kary za obrót detaliczny bez zezwolenia lub wbrew jego warunkom trwały w czterech zbadanych sprawach od 66 do 1400 dni, średnio 473,5 dnia. GIF 9 marca 2026 r. polecił stosować art. 36 § 1 Kpa. Strona może też wnieść ponaglenie.